hmmer建立hmmscan-CSDN博客

网站介绍:文章浏览阅读2.7k次,点赞5次,收藏2次。学术辣鸡前两天想要用hmmsearch 比对文件,但是发现hmmsearch所使用的pfam-a.hmm他就是一个hmm,依赖数据库vogdb就没有一个完整的hmm,所以不会设置。。。。然后我发现了hmmscan(学术辣鸡没有认真查看HMMER说明书HMMER User’s Guide,淦,hmmscan写了可以在调用任务之前把所有文件整合成一个hmm,调用的时hmmpress:Constructs binary compressed datafiles for hmmscan, starting f_hmmscan